Revista Peruana de Biología

Surface adhesion fermentation: a new fermentation category

Basic knowledge on solid state fermentation and on biofilm formation is summarized and related to cell adhesion processes. These subjects are covered from the engineering and molecular biology points of view. Contrary to the common believe, the advantages of solid state fermentation are related to the adhesion of fungi to solid particles instead of being due to the low water content. Thus, solid state fermentation and biofilm fermentation (erroneously known as adsorption immobilization) are technical variants of the same biological process, and should be referred as Surface Adhesion Fermentation.

Se resume el conocimiento básico sobre la fermentación en estado sólido y la formación de biopelículas y se relaciona con los procesos de adhesión celular, cubriendo puntos de vista de ingeniería y de biología molecular. Contrariamente a la creencia común, la ventaja de la fermentación en estado sólido está relacionada a la adhesión de los hongos a partículas sólidas y no al bajo contenido de agua. Por lo tanto, la fermentación en estado sólido y la fermentación en biopelículas (erradamente conocida como inmovilización por adsorción) son variantes técnicas del mismo proceso biológico y deben ser referidas como Fermentación por Adhesión a Superficies.

Antibacterial activity of ethanolic extracts of marine algae from central coast of Peru

Se evaluó la actividad antibacteriana de extractos etanólicos de 12 especies de macroalgas marinas. Los extractos fueron obtenidos de acuerdo al protocolo modificado de Vlachos et al. (1996). Cada extracto se enfrentó contra 5 cepas bacterianas de origen clínico y 6 no clínico perteneciente a los géneros Staphylococcus, Enterococcus, Pseudomonas, Escherichia, Salmonella, Aeromonas y Vibrio. De 12 especies de algas ensayadas solamente 5 (Grateloupia doryphora, Ahnfeltiopsis durvillaei, Prionitis decipiens, Petalonia fascia y Bryopsis plumosa) presentaron algún efecto antibacteriano. Asimismo, de 11 cepas bacterianas probadas solamente las cepas clínicas Staphylococcus aureus ATCC 25923 y Enterococcus faecalis ATCC 29212 y la cepa no clínica Staphylococcus aureus ATCC 6633 fueron sensibles a los extractos algales. El extracto etanólico de B. plumosa presentó el mayor efecto antibacteriano contra las dos cepas de S. aureus, manifestándose en el mayor tamaño de sus halos de inhibición, mientras que el extracto de P. fascia mostró mayor espectro antibacteriano, inhibiendo a las 3 cepas mencionadas.

Antibacterial activity of ethanolic extracts from 12 macroalgae were evaluated. Extracts were obtained according to the protocol of Vlachos et al. (1996). Extracts were tested against with 5 clinic strains and 6 no clinic strains of the genus Staphylococcus, Enterococcus, Pseudomonas, Escherichia, Salmonella, Aeromonas y Vibrio. Only Grateloupia doryphora, Ahnfeltiopsis durvillaei, Prionitis decipiens (Rhodophyta), Petalonia fascia (Phaeophyta) and Bryopsis plumosa (Chlorophyta) showed some antibacterial activity against the clinic strains Staphylococcus aureus ATCC 25923 and Enterococcus faecalis ATCC 29212 and the no clinic strain Staphylococcus aureus ATCC 6633. Ethanolic extract of B. plumosa presented the highest antibacterial activity against S. aureus strains. The extract of P. fascia showed the highest antibacterial activity against the three sensible strains.

Coliphages as fecal pollution and removal bacterial indicators in the drinking water process

El presente trabajo analiza la eficacia del tratamiento de agua procedentes del río Rímac. Se comparan muestras de agua no tratadas con las fases sucesivas del tratamiento: decantación, filtración y clorinación. La cuantificación de colifagos fue realizada por los métodos de Capa Simple y Filtro de Membrana. Los Coliformes Totales (CT), Coliformes Termotolerantes (CTT) y Bacterias Heterótrofas (BH) fueron determinados por los métodos del Número Más Probable (NMP) y Filtro de Membrana. La cepa estándar de E. coli C ATCC 13706 fue utilizada como hospedera de colifagos. Los promedios de colifagos cuantificados fueron de 2267,25 UFP/100 mL en las muestras sin tratamiento; 2,11; 2,04 y 1,07 UFP/100 mL en las muestras procedentes de la decantación, filtración y clorinación respectivamente. No se detectaron CT y CTT en muestras de agua clorinada. La correlación entre colifagos y CT en muestras de agua decantada y filtrada (r = 0,3793 y r = 0,3629 respectivamente) fueron significativas (p<0,05). En las muestras de agua sin tratamiento no fueron significativas las correlaciones (r = 0,3048, p0,05). La correlación entre colifagos y los CTT con las muestras de tratamientos fue significativa (r = 0,7129; 0,5326 y 0,4612, para muestras con decantación, filtración y clorinación respectivamente, p<;0,05). Los porcentajes de remoción microbiana respecto de la muestras de agua sin tratamiento fueron del 99,95 % para los colifagos, 99,99 % para las BH y 99,99 % para los CT y CTT.

This work compare the efficiency of water treatment from Rimac river. Samples from different phases of water treatment (decanted, filtered and chlorinated) were compared with not treated samples. Coliphages quantification was made by Simple Layer and Membrane Filter methods. Most Probable Number (NMP) and Membrane Filter methods were used to assessment of Total Coliforms, Coliforms Thermotolerants and Heterotrophic Bacteria. The standard strain of E. coli C ATCC 13706 was used as coliphages host. The averages of quantified coliphages were of 2267,25 UFP/100 mL in samples with out treatment; 2,11, 2,04 and 1,07 UFP/100 mL in the water samples from decanted, filtered and chlorinated treatment respectively. Total Coliforms and Coliforms Thermotolerants were not detected in samples of chlorinated water. The correlation between coliphages and Total Coliforms in samples of decanted and filtered water (r = 0,3793 and r = 0,3629 respectively) were significant (p <0,05) Samples with out treatment don't were significant (r = 0,3048, p0,05). Correlations between coliphages and the Coliforms Thermotolerants were significant with water samples from treatment decanted, filtered and chlorinated (r = 0,7129; 0,5326 and 0,4612, p <0,05). The microbial removal percentages were 99,95 % for the coliphages, 99,99 % for the BH and 99,99 % for the CT and CTT.

Poaceae from Yanachaga-Chemillén National Park (Oxapampa, Pasco, Perú). Part I: Bambusoideae

El presente trabajo es la primera parte de un estudio de la biodiversidad de la familia Poaceae del Parque Nacional Yanachaga-Chemillén y zonas aledañas, (10º 35' - 10º 10' LS y 75º 10' - 75º 45' LO, y desde los 300 hasta los 3800 m). El material utilizado procedió de colectas realizadas por los autores desde 1995 a 1996 y de material depositado en el Herbario San Marcos (USM) del Museo de Historia Natural y del Missouri Botanical Garden (MO). En esta primera parte se da a conocer la diversidad de la subfamilia Bambusoideae. En el área de estudio han sido registradas para la subfamilia Bambusoideae 7 géneros y 23 especies. Entre las Bambusoideas leñosas el género Chusquea presentó el mayor número de especies (siete). El género Olyra es el mejor representado entre las Bambusoideas herbáceas con cinco especies. Se presenta una breve descripción de la subfamilia y los géneros, así como también claves para diferenciar los géneros y especies. Para cada especie se indican datos de su ecología, distribución y el material estudiado.

This work is the first part of biodiversity study of Poaceae family from Yanachaga-Chemillen National Park and surroundings places (10º35´ - 10º10´ S and 75º10´ - 75º45´ W and from 300 to 3800 m). We analysed the material colected for us since 1995 to 1996 and material deposited in the Herbario San Marcos of Museo de Historia Natural and Missouri Botanical Garden. This first part is dedicated to the Bambusoideae biodiversity. A total of seven genera and 23 species have been registered. In the woody bamboos group, genus Chusquea was the mayor species number (seven). The genus Olyra is the most diverse of the herbaceous bamboos with five species. Descriptions of subfamily, genera and keys for genera and species are developed. Ecology, distribution and studied material are indicated.

Wild flora from central Andes of Peru: study of the Quilcas zone, Junín

El presente trabajo es un estudio taxonómico de la flora fanerogámica silvestre del distrito de Quilcas, Junín, en los Andes centrales del Perú. Se reporta la presencia de 214 especies de plantas comprendidas en 140 géneros y 52 familias. Las familias con mas diversidad son las Asteraceae con 55 especies y Poaceae con 22 especies. Se dan a conocer 32 nuevos registros de distribución para el departamento de Junín. El análisis de afinidades florísticas permite concluir que la zona de Quilcas es semejante a otras áreas de los Andes peruanos.

This work is a taxonomic study of the wild flora from Quilcas, Junin, in the central Andes of Peru. There are reported 214 species of plants in 140 genera and 52 families. Highest diversity is on Asteraceae with 55 species, and Poaceae with 22 species. There were reported 32 species as new for Junin. Floristic affinity analysis us may conclude similarity of Quilca with others regions of Peruvian Andes.

Evaluation of the conservation status of the game mammals: a comparative model in communities of the Pacaya Samira National Reserve (Loreto, Peru)

El presente trabajo contiene información relacionada a la caza, la abundancia y el impacto de la caza de los mamíferos que habitan los bosques inundables aledaños a dos comunidades asentadas en el interior de la Reserva Nacional Pacaya Samiria. Está basado en registros de caza y censos por transectos. Los registros de caza muestran un promedio de cosecha anual de 190,3 mamíferos del área de San Miguel, equivalente a 2275,9 kg de carne de monte, y 104,5 mamíferos del área de Parinari, equivalente a 985,9 kg de carne de monte. Los primates fueron los más abundantes en ambas áreas de estudio; sin embargo, las densidades estimadas fueron mayores para el área de Parinari. Ninguna especie de ungulados fue observada en el área de San Miguel, mientras que para el área de Parinari la densidad del tapir (Tapirus terrestris Linnaeus) fue estimada en 0,2 individuos/ km2 y para el pecarí labiado (Tayassu pecari Link) en 6,6 individuos/ km2 . Finalmente, el modelo de cosecha sugiere sobrecaza para el tapir, maquisapa cenizo (Ateles belzebuth E. Geoffroy), choro (Lagothrix lagotricha Humboldt) y mono aullador (Alouatta seniculus Linnaeus), cuyas cosechas en algunos casos alcanzaron el 100% de la producción. Se discuten los factores que podrían influir para la escasez y/o ausencia de algunas especies, particularmente ungulados y primates.

This paper contains information about the hunting, abundance and the hunting impact of the mammals that inhabit the lowland forests of the area surrounding two communities in the interior of the Pacaya Samiria National Reserve. It is based on hunting records and transect censuses. Hunting records show an average annual harvest of 190,3 mammals in the San Miguel area, equivalent to 2,275,9 kg of bushmeat; and 104,5 mammals in the Parinari area, equivalent to 985,9 kg of bushmeat. Primates were abundant in both study areas; however, the estimated densities were much higher in the Parinari area. No ungulates species were observed in the San Miguel area, whilst in the Parinari area the density of tapir (Tapirus terrestris Linnaeus) was estimated at 0,2 individuals/ km2 and that of white lipped peccary (Tayassu pecari Link) at 6, 6 individuals/km2. Finally, the harvest model suggests overhunting of the tapir, white bellied spider monkey (Ateles belzebuth E. Geoffroy), common wooly monkey (Lagothrix lagotricha Humboldt) and red howler monkey (Alouatta seniculus Linnaeus), for which harvest in some cases reached 100% of the production. We discuss the factors that should influence the scarcity and/or absence of some species, particularly ungulates and primates.

Additions of Protozoan to Pantanos de Villa fauna, Lima, Peru

En nueve estaciones ubicadas en los cuerpos de agua de los Pantanos de Villa, Chorrillos, Lima; fueron realizadas colectas mensuales entre octubre de 1999 y agosto del 2000. Se determinaron 128 especies de protozoarios distribuidos en 101 géneros, 69 familias y 28 órdenes. De las 128 especies, 73 especies son registros nuevos para los Pantanos de Villa, reportándose hasta la actualidad un total de 171 especies de protozoarios para este lugar. El grupo predominante fue el de los ciliados con el 61,72% de las especies registradas, seguidos por los mastigóforos con el 21,87% y los sarcodinos con el 16,41%. El grupo más abundante fué el de los mastigóforos con el 75% de los individuos seguido de los ciliados (19,5%) y sarcodinos (4,5%).

Monthly surveys between October 1999 to August 2000 were carried out in nine stations from ponds of the Pantanos de Villa, Chorrillos, Lima. It was determined 128 species of protozoa, distributed in 101 genus, 69 families and 28 orders. A total of 73 species were new report in Pantanos de Villa. At the present time a total of 171 species of protozoa had been reported. The Ciliate was more diverse group with 61,72% of species, following for Mastigophora (21,9%) and Sarcodina (16,4%). The highest abundance was Mastigophora (75%), following Ciliate (19,5%) and Sarcodina (4,5%).

Limnological characteristics of the Amazonic Cashibococha Lake (Ucayali-Peru) at 2001

Durante el año 2001 se realizaron muestreos bimensuales en tres estaciones fijas en la laguna de Cashibococha (Ucayali, Perú). Cashibococha presenta aguas de color verdoso a café oscuro, con pH entre 6 a 6,8, Conductividad entre 10 y 30myS.cm -1, Transparencia de 21 a 59 cm y Alcalinidad Total entre 14 y 22 mg CaCO3 / L . La temperatura superficial del agua osciló entre 24,4 y 37 ºC y el Oxígeno Disuelto entre 1,3 y 7,4 mg/ L. Los análisis bacteriológicos registraron recuentos de aerobios mesófilos entre 350 y 3600 UFC/ mL. Los coliformes totales oscilaron entre 3 y 43 NMP/ 100 mL. Se diferenciaron 47 especies pertenecientes a 20 familias de macrófitas acuáticas; el mayor número de especies se reportó durante la época de Transición - Creciente (octubre - noviembre), debido a la inundación del bosque. Fueron identificadas 52 especies de fitoplancton, la División Chlorophyta fue la mas dominante. La comunidad fitoplanctónica está dominada por las especies Actinastrum hantzschi, Spirogyra sp., Eudorina elegans, Pandorina morum y Closterium kuetzingui. Se diferenciaron 54 especies de Zooplancton. Los rotíferos fue el taxa dominante. La densidad de zooplancton está dominada por Brachionus patulus macracanthus y Polyarthra vulgaris. Fueron identificadas 66 especies de peces, pertenecientes a 55 géneros, 11 familias y 4 órdenes. El orden dominante en diversidad y abundancia fue el de Characiformes, Curimata vittata fue la especie dominante en la comunidad de peces en éstas áreas litorales. Los índices de diversidad fueron superiores a 3,0 bits. ind-1, en todas las estaciones y lugares de muestreo. De igual manera los valores de equitabilidad fueron superiores a 0,8 en todas las estaciones y lugares de muestreo.

Cashibococha lagoon was studied during 2001 year. Three stations were bimonthly sampling. Cashibococha have greenish to brownish colour water, pH between 6 to 6,8, Conductivity 10 to 30 muS.cm-1, Transparency 21 to 59 cm and Total Alkalinity 14 to 22 mg CaCO3 / L. Surface temperature were between 24,4 and 37° C and Dissolved Oxygen 1,3 and 7,4 mg / L. Bacteriological analysis report 350 to 3600 CFU / mL for mesophilic aerobic bacteria and 3 to 43 NMP / 100 mL for total Coliforms. A total of 47 species of Freshwater Macrophytes were recorded and mayor diversity was associated with inundation of the forest period (octubre - noviembre). A total of 52 phytoplankton species were found, Chlorophyta Division was the dominant and Actinastrum hantzschi, Spirogyra sp., Eudorina elegans, Pandorina morum y Closterium kuetzingui were the principal species. In zooplankton community was recorded 54 species and the taxa dominant was Rotifera with Brachionus patulus macracanthus and Polyarthra vulgaris as principal species. Characiforms fishes was dominant and Curimata vittata the principal specie. Shannon-Wiener diversity index were highest to 3,0 bits. ind-1 in all places and times of sampling.

Reproductive behaviour and mutilations in sally lightfoot Grapsus grapsus (Linnaeus, 1758) (Crustacea, Decapoda)

El presente trabajo analiza información de las mudas y observaciones del comportamiento reproductivo de G. grapsus, relacionando las frecuencias de mutilaciones y el comportamiento caníbal observado en las cópulas. Las colectas de mudas y observaciones sobre las cópulas se llevaron a cabo entre diciembre de 1990 y diciembre de 2001, en 200 m de una orilla rocosa al sur de la Bahía de Ancón, Lima, Perú. G. grapsus vive en grupos de número variable y asociados a grietas donde los individuos buscan refugio. El comportamiento de cortejo observado fue el de "búsqueda-intercepción" he incluyó diferencias como la defensa de territorios no temporales, largas persecusiones e intercepción por varios machos. Un total de 312 cópulas fueron observadas siendo más frecuentes durante el verano. Un total de once intentos de cópula produjeron la muerte de los individuos, siete fueron machos. En todo el periodo de estudio se colectaron un total de 8421 mudas de las cuales 418 presentaban mutilaciones o heridas en el cefalotórax o abdomen. No se observan diferencias significativas entre las tallas de mutilados de ambos sexos. El 73% de las mudas mutiladas presentan una sola mutilación, el 20% presentan dos mutilaciones y el 6% tres; se encontraron mudas hasta con siete apéndices mutilados. Las frecuencias de mutilaciones son significativamente mayores en machos. Las mutilaciones de las quelas y la segunda pata caminadora son más frecuentes en machos, mientras que en las hembras las mutilaciones de la cuarta y tercera pata caminadora son más frecuentes. Se propone que las mutilaciones se producen durante los intentos de cópula, principalmente por diferencias entre el tamaño de los individuos.

We have analysed molt frequency and reproductive behaviour of G. grapsus in relation to mutilation frequency and cannibalism observed during mating. Observations and surveys were carried out between December 1990 and December 2001, on a 200 m stretch rocky shore in the south of Ancon Bay, Lima, Peru. Population of G. grapsus was organized in groups of variable numbers around crevices. The courtships behaviour of G. grapsus was based on the "search-interception" process including the defence of semi-permanent territory, along mate-tracking behaviour and interception by several males. A total of 312 copulation events were observed with the highest in summer. Eleven matings ended in death, seven victims of those being males. In this study 8421 molts were collected, 418 had mutilations or injuries in the cephalothorax or abdomen. There was no significant difference in the sizes of mutilated individuals between the two sexes. 73% of mutilated molts had one mutilation (injury), 20% two mutilation and 6% three mutilations and up to seven mutilations were recorded. Frequency of mutilation was significantly higher in males than in females. Mutilated appendices were different between sexes. Chela and second legs were more frequently mutilated in males and the fourth and third legs in females. We propose that mutilations observed were produced during copulation, manly due to size sizes.

First record of helminth parasites in Fulica ardesiaca (Aves: Rallidae) from Peru: Pantanos de Villa - Lima

En el presente trabajo se registran por primera vez para el Perú, los parásitos de un ejemplar de Fulica ardesiaca "gallareta andina" colectada en los Pantanos de Villa. Se colectaron un total de 698 especimenes: los tremátodos Notocotylus pacifera y Psilostomum sp. con 529 y 149 individuos respectivamente y el céstodo Diorchis americana, con 20. El presente trabajo constituye el primer reporte para el Perú de helmintos en F. ardesiaca y Psilostomum sp. y D. americana son primeros registros para la helmintofauna peruana.

Two trematodes and one cestode of Fulica ardesiaca from Pantanos de Villa, Lima, Peru are registered at first time. Total of 698 parasites were counted, 529 individuals of Notocotylus pacifera, 149 individuals of Psilostomum sp. and 20 individuals of Diorchis americana. This work is the first report in F. ardesiaca from Peru; while Psilostomum sp. and D. americana are first registrations for the Peruvian's helminthes.

New records of bivalve from Peruvian Sea

Seis especies de bivalvos: Thyasira flexuosa (Montagu, 1803); Diplodontina tumbesiana Stempell, 1899; Retrotapes exalbidus (Dillwyn, 1817); Pandora (Pandorella) cornuta C.B. Adams, 1852; Entodesma cuneatum (Gray, 1828); Periploma (Cricoploma) carpenteri Dall, 1896 se reportan por primera vez para el Mar Peruano. Se incluyen datos sobre la distribución, el hábitat y comentarios relevantes de cada una de las especies.

Six bivalve species: Thyasira flexuosa (Montagu, 1803); Diplodontina tumbesiana Stempell, 1899; Retrotapes exalbidus (Dillwyn, 1817); Pandora (Pandorella) cornuta C.B. Adams, 1852; Entodesma cuneatum (Gray, 1828); Periploma (Cricoploma) carpenteri Dall, 1896 are the first time reported for Peruvian sea. Distribution, habitat and relevant observations of each one species are included.

Separation and identification of some toxins from Centruroides margaritatus venom (Gervais,1841) (Scorpiones : Buthidae)

Las proteínas del veneno del escorpión Centruroides margaritatus, fueron separadas mediante cromatografía de intercambio catiónico en CM-Sephadex C-25 con buffer acetato de amonio 0,05M a pH 7, a partir de 28,3 mg de veneno obtenidos de 52 ejemplares adultos capturados en la provincia de Zarumilla, Tumbes, norte del Perú. El perfil cromatográfico mostró la presencia de 9 picos de proteína y los ensayos de toxicidad han permitido identificar tres tipos de toxinas, cada una específica para crustáceos, insectos y roedores, respectivamente. Tanto en el veneno crudo como en las fracciones colectadas, no se encontró actividad de fosfolipasa ni actividad proteolítica. La PAGE-SDS del veneno crudo, muestra la presencia de una banda bastante notoria de aproximadamente 14 KDa, y otras dos muy tenues, de aproximadamente 45KDa, lo cual significa que la mayoría de proteínas de este veneno son de peso molecular igual o menor a 14KDa.

Proteins of Centruroides margaritatus scorpion venom had been separated by cationic exchange chromatography in CM-Sephadex C-25 with 0,05M ammonium acetate pH 7, from 28,3 mg of venom obtained from 52 adults scorpions caught in Zarumilla, Tumbes, north of Peru. The chromatographic elution showed 9 protein peaks and toxicity assays allowed the identification of three toxins with specific activity on crustacean, insects and rodents, respectively. Both the crude venom and the collected fractions have shown neither phospholipase nor proteoyitic activity. The PAGE-SDS of crude venom shows one very notorious protein band of 14 kDa aproximately, and another two thin bands of 45 kDa aproximately, which imply that the majority of proteins from this venom are of a molecular weight similar or less than 14kDa.

Vascular Plants of the Chimbote Wetlands, Peru

Los humedales de Chimbote (09°05'51"S; 78°32'52"O) presentan una flora vascular compuesta por 41 especies en 18 familias. El 61% magnoliópsidas y el 39% liliópsidas. Las familias con mayor número de especies fueron Poaceae, Cyperaceae y Asteraceae. Las formas de crecimiento dominantes fueron las hierbas (85%) seguidas de arbustos (10%). En comparación con los humedales costeros de Lima, en Chimbote se presenta mayor riqueza de especies que en Medio Mundo (16 especies) y El Paraíso (25), aunque menos que en Los Pantanos de Villa (66). Un análisis de agrupamiento indica una mayor similitud con el humedal de Los Pantanos de Villa. En estos humedales se presentan cuatro tipos de comunidades vegetales. La mayor diversidad de especies es encontrada en la desembocadura del río Lacramarca.

The vascular flora of Chimbote's wetlands (09°05'51"S; 78°32'52"W) is composed of 18 families and 41 species. Sixty one percent of the species are Magnoliopsida and 39% belong to the Liliopsida. Families with the largest number of species are Poaceae, Cyperaceae and Asteraceae. The dominant growth forms are herbs (85%), followed by shrubs (10%). A comparison with coastal wetlands of Lima, shows that Chimbote has more species that Medio Mundo (16 species) and El Paraíso (25) but less that Los Pantanos de Villa (66). A cluster analysis found greater similitude with Los Pantanos de Villa. In Chimbote's wetland is found four types of plant communities. The greater species diversity is found in the Lacramarca river's outlet.