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Arnaldoa
versión impresa ISSN 1815-8242versión On-line ISSN 2413-3299
Resumen
PEDRO HUAMAN, Juan J. y MOYA CHAVEZ, Loana. Análisis in silico, estructural y funcional de la proteína ACE2 en diferentes vertebrados y su relación con SARS-COV-2. Arnaldoa [online]. 2024, vol.31, n.1, pp.151-169. Epub 20-Abr-2024. ISSN 1815-8242. http://dx.doi.org/10.22497/arnaldoa.311.31108.
A finales del 2019, se manifestó una nueva afección respiratoria de carácter infecciosa ubicada en la provincia de Hubei Wuhan-China causada por el virus SARS-CoV-2. Por otra parte, la enzima convertidora de angiotensina 2 (ACE2) se identificó rápidamente como el receptor funcional crítico para el SARS-CoV-2. El estudio de la proteína ACE2 permite determinar los posibles reservorios que podría tener en la naturaleza coronavirus como SARS-CoV, SARS-CoV-2 entre otros. La presente investigación tiene como objetivo analizar estructural y funcionalmente la proteína ACE2 en diferentes clases de vertebrados. Para ello se recuperó un total de 35 secuencias aminoacídicas, realizándose un análisis preliminar con ProtParam, SMART, InterPro y CATHdb. La estructura secundaria de las proteínas de 10 especies seleccionadas se predijo utilizando la herramienta PSIPRED. Posteriormente, se modeló la estructura terciaria con MODELLER 10.4 y se realizó la validación mediante Procheck. El refinamiento se realizó mediante las herramientas ModRefiner y GalaxyRefine, para la alineación estructural se usó CLICK. Se observó que las propiedades fisicoquímicas, dominios y funciones de las diferentes clases de vertebrados son muy similares. De igual forma, se puede observar que la estructura secundaria encontrada con mayor prevalencia en las proteínas fue la alfa hélice. Finalmente, existe una alta conservación en la estructura tridimensional al compararla con la de Homo sapiens. Esta conservación evolutiva denota su importancia para los seres vivos e indica la potencial susceptibilidad de las diferentes especies a los coronavirus mediante el mismo receptor ACE2.
Palabras clave : coronavirus; receptor; modelamiento por homología; dominios; alfa hélice; hospederos.